El Patronato de IMDEA-Agua es su máximo órgano de gobierno, representación y administración. De acuerdo con los estatutos, formará parte de él tres miembros natos en representación de la Comunidad de Madrid y hasta un máximo de doce personalidades de reconocido prestigio internacional en las materias científicas del Instituto.

PATRONATO	CONSEJO CIENTÍFICO	ADMINISTRACIÓN
Sra. Dª Carmen González Fernández (Viceconsejera Educación) Sr. D. Alfonso González (SDG Investigación) Sra. Dª Mª Jesús Villamediana (D.G. Calidad y Evaluación Ambiental) Dr. Adriano García-Loygorri Dr. Julián Martínez Beltrán Dr. Manuel R. Llamas Madurga (RACEFN) Dr. Stephen Foster (UK) Dr. Avelino González González (UE-DGR) Dr. M. Vighi (U. Milán) Dr. José C. Merchuk (U. Bengurion) Sr. D. Jesús Martín Sanz (AEDHE) Sr. D. Rafael Fernández Rubio Sr. D. Juan José Vaquero López (UAH) Sr. D. José Luis Sotelo Sancho Sr. D. Pedro González-Trevijano Sr. Dª Milagros Couchoud Gregori	Dr. Adriano García-Loygorri Dr. Julián Martínez Beltrán Dr. Manuel R. Llamas Madurga Dr. Stephen Foster Dr. Avelino González Dr. M. Vighi Dr. José C. Merchuk Dr. Rafael Fernández Rubio Dr. Félix Cristobal Dr. Bo Jansson Dr. Andreas Nicholaos Angelakis	Eloy García Calvo (Director General) Irene de Bustamante (Directora Adjunta) Pablo Traspas (Gerente)